Oltre alle tarature della velocità e dello zero trattate nella sezione precedente, i misuratori di spessori a ultrasuoni richiedono una serie di configurazioni hardware e software che incidono sulla forma e sulla dimensione dell'impulso ultrasonoro in uscita e su come gli echi ricevuti sono elaborati e temporizzati. Queste configurazioni cambiano in funzione della scelta del trasduttore, del tipo di materiale e dell'intervallo di spessore da misurare. In alcuni casi questi parametri sono definiti automaticamente attraverso il software di riconoscimento della sonda, specialmente nel caso dei misuratori di spessore. In numerosi altri casi un operatore può semplicemente richiamare una configurazione di misuratore predefinita che include delle configurazioni ottimali per una specifica applicazione. Tuttavia i misuratori avanzati permettono anche di regolare dei parametri di configurazione e di creare delle configurazioni ottimizzate come richiesto da applicazioni altrimenti non gestibili.
Le configurazioni personalizzate vengono in genere utilizzate quando le esigenze di misura di una specifica applicazione non sono soddisfatte pienamente da una delle configurazioni standard disponibili in un misuratore.
Le regolazioni delle configurazioni di questo tipo possono essere effettuate solamente da un tecnico qualificato che ha dimestichezza con al teoria di base delle misure a ultrasuoni e l'interpretazione delle forme d'onda ultrasonore. Numerose di queste regolazioni sono interattive e influenzano l'intervallo di misura e/o la precisione di misura. Nella maggior parte dei casi, le regolazioni non dovrebbero essere eseguite senza la verifica delle forme d'onda attraverso le schermate delle forme d'onda integrate o dei programmi ausiliari. Inoltre, quando si prepara una configurazione personalizzata per un'applicazione specifica, è essenziale verificare le prestazioni su dei campioni di riferimento rappresentativi dei materiali e dell'intervallo degli spessori da misurare prima di acquisire i dati.
La sezione successiva tratta alcuni parametri di configurazione regolabili che sono in genere disponibili con i misuratori a ultrasuoni avanzati. Notare che non tutte queste regolazioni saranno necessariamente disponibili per uno specifico modello.