こちらは、
オリンパスが提供するOLYMPUS Stream 操作説明ビデオです。
このビデオでは、
OLYMPUS Stream画像解析ソフトウエアで粒子を分離して
カウントと計測を実行する手順について詳しく解説します。
計測対象となる粒子の輪郭が
はっきりとした画像を取り込んだ後、
「処理」レイアウトの「カウントと計測」ツール・ウィンドウを
用いて、計測を行います。
まず、画像のしきい値を設定します。
しきい値により、
輝度値またはカラー値を識別して、
背景から粒界を抽出できます。
「自動しきい値」を選択してみましょう。
OLYMPUS Streamソフトウエアによって、
サンプルの画像に最適なしきい値が決定されます。
通常は、この自動検出で最適なしきい値を設定できます。
何らかの理由で対象点を完全に抽出できない場合は、
「キャンセル」をクリックして手動しきい値に変更します。
ドロップダウンをクリックすると、
他のしきい値処理方法が表示されます。
「手動HSVしきい値」では、
画像の色相、彩度、輝度に基づいて
しきい値を設定できます。
「手動しきい値」では、各色の輝度
またはグレー値の輝度を選択できます。
「適応しきい値」では、カラー画像に対し、
グレースケールで輝度選択が可能です。
「手動しきい値」を選択して、機能を見てみましょう。
「手動しきい値」を開くと、
ヒストグラムのスライダーを調整して
カラーチャネルごとに特定の輝度レベルを含めたり、
スポイト・ツールで使用することによって
範囲を増減したりすることができます。
「手動しきい値」をキャンセルして、自動モードを使用しましょう。
先ほどと同様に、ドロップ・ダウンをクリックし、「自動しきい値」モードを選択します。
このカラー画像の場合、自動モードで
各粒子のしきい値を適切に検出できるため、
このまま「カウントと計測」を選択して、
粒子のカウントを実行できます。
「カウントと計測」のボタンにも応用機能があり、
ボタン2のドロップダウンをクリックすると表示されます。
応用機能を1つずつ見ていきましょう。
最初の応用機能では、画像全体または対象領域に対し、
カウントと計測を実行できます。
その下のオプションでは、矩形、円、または多角形によって
新しい対象領域を定義できます。
粒子検出の対象領域は複数指定できます。
これにより、対象領域の範囲に対する
粒子のフェーズ分析が可能です。
「検出のオプション」では、境界粒子のカウントや、
粒子の色分け方法などの設定を変更できます。
ここで、クラス分類に関するオプションを選択したり、
現在の分類を調整したりすることもできます。
これをクリックして計測を続けましょう。
ご覧のように、サンプル上で検出された粒子が表示されています。
粒子同士が接触しているものがあるため、
それらに対して粒子の分割を実行する必要があります。
それには、「カウントと計測」ツール・ウィンドウの
「検出されたオブジェクトの選択」の矢印をクリックします。
そうすると、特定の粒子をクリックして選択し、
追加の機能を実行できる状態になります。
1個の粒子としてカウントされている
接触している粒子を選択してみましょう。
次に、手動で粒子の境界線を引いて粒子を分割するか、
自動分割オプションを使用するかを
選択します。
自動分割オプションを試してみましょう。
この粒子は、形状に基づいて2個の粒子として容易に判定できます。
2個の粒子に分離され、
「オブジェクト計測」リストが更新されました。
次に、1個の粒子としてカウントされている他の接触粒子を
バッチ・シーケンスで処理してみましょう。
まず、「カウントと計測結果」ウィンドウの
「オブジェクトのID」タブをクリックして、すべての粒子を選択します。
検出された粒子がすべて選択されます。
次に、再び「自動分割」機能を選択して、
分離が必要と判定可能なすべての粒子に対して実行します。
完了後、変更されたものは新たに分離された粒子として表示され、
「オブジェクト計測」リストが更新されます。
「オブジェクトのクラス」フィールドをダブルクリックすると、
生成された2つのクラスが並べ替えられ、
異なる粒子を容易に識別できます。
クラス1にリストされた粒子をクリックしてみましょう。
このクラスは、形状係数によって粒子を分離しています。
これがクラス1の最初の粒子です。
これはクラス1の2番目の粒子です。
ご覧のように、これは不完全な粒子ですので、
解析から除去する必要があります。
これはクラス1の3番目の粒子です。
そして、クラス1の最後の粒子です。
2番目の粒子を除去するために、
クリックして戻ります。
この粒子を除去または削除するには、
粒子を右クリックしてオプションを表示します。
「選択されたオブジェクトの削除」を選択すると、
解析からこの粒子が除去されます。
粒子の除去が完了すると、
「オブジェクト計測」リストが更新されます。
次に、「オブジェクトフィルタ」ウィンドウについて説明します。
このウィンドウでは、いずれかの計測方法によって
粒子をフィルタ処理できます。
例えば、面積、アスペクト比、粒径、最大長などによる
フィルタ処理が可能です。
フィルタ処理によって対象の粒子を
除外または包含することができます。
計測値を選択し、
最小または最大フィルタ範囲を選択すると、
最小または最大粒子を手動で設定できます。
あるいは、ヒストグラムのスライダーを手動調整して
特定の範囲を包含または除外することもできます。
この解析ではフィルタ処理は適用しません。
次に「クラス計測」ウィンドウです。
このウィンドウには、各クラスの詳細が表示されます。
クラス1は「平均円形度」に基づく設定です。
この設定では、形状が矩形の粒子をクラス1、
円形の粒子をクラス2に分類できます。
各クラスの「オブジェク数」のほか、
必要な計測値を表示できます。
次のウィンドウには、クラスのヒストグラムが表示されます。
このヒストグラムは、レポート作成ツールで使用するグラフにエクスポートすることもできます。
それには、「グラフにエクスポート」ボタンをクリックします。
このチャートをエクスポートしてみましょう。
「クラスヒストグラム」がチャートとして開きます。
このチャートは、レポート作成ツールで使用したり、
データベースやファイルに保存したりすることができます。
上側のタブをクリックして画像に戻りましょう。
「オブジェクト計測」タブをクリックして開きます。
「ワークブックにエクスポート」ボタンをクリックすると、
OLYMPUS Stream内で使用可能なワークブックに
「オブジェクト計測」リストが転送されます。
これで、リストがワークブックにインポートされました。
このワークブックは、データベースやファイルに保存したり、
レポートに含めたりすることができます。
この操作説明ビデオでは、OLYMPUS Stream画像解析ソフトウエアで
粒子を分離してカウントと計測を実行する方法について解説しました。
質問等がございましたら、弊社まで直接お問い合わせください。
ご視聴ありがとうございました。